Органът има следните задачи:
а) да предоставя на институциите на Общността и държавите-членки възможно най-добрите научни становища във всички предвидени от законодателството на Общността случаи, както и по всички въпроси от неговата компетентност;
б) да насърчава и координира разработването на единни методологии за оценка на риска в области от неговата компетентност;
в) да оказва научна и техническа помощ на Комисията в области от неговата компетентност, когато тя е поискала това, по тълкуването и разглеждането на становища за оценката на риска;
г) да възлага научни изследвания, които са необходими за изпълнението на неговите функции;
д) да издирва, събира, съпоставя, анализира и обобщава научни и технически данни в области от неговата компетентност;
е) да предприема действия за установяване и охарактеризиране на възникващите рискове в области от неговата компетентност;
ж) да изгради система от мрежи, които да обхващат организации, работещи в области от неговата компетентност, и да отговаря за тяхното функциониране;
з) по искане на Комисията, да оказва научна и техническа помощ при прилаганите от Комисията процедури за управление на кризи във връзка с безопасността на храните и фуражите;
и) по искане на Комисията, да оказва научна и техническа помощ в областите от неговата компетентност с оглед подобряване на сътрудничеството между Общността, страните-кандидатки за членство, международни организации и трети страни;
й) да гарантира, че обществеността и заинтересованите страни получават бърза, надеждна, обективна и изчерпателна информацията в области от неговата компетентност;
к) да изразява независимо своите заключения и възгледи по въпроси от неговата компетентност;
л) да изпълнява всички други възложени му от Комисията задачи от неговата компетентност;
м) да си сътрудничи с компетентните органи на държавите членки, които изпълняват задачи, сходни с тези на органа, и с други научни институции, създадени в съответствие с правото на Съюза, и по-специално Европейската агенция по химикали, Европейската агенция по лекарствата и Европейската агенция за околна среда, по отношение на осигуряването на съответни научни становища, по отношение на обмена на данни и информация, включително по отношение на потенциалното създаване на свързани с тях формати на данните и контролирани речници с цел улесняване на такъв обмен, както и по отношение на разработването на научни методики за оценката на химикали.